民眾黨總統參選人柯文哲在藍白協商退讓，導致黨內士氣低迷。柯文哲16日在一場競選幹部的線上會議中解釋退讓原委，並透露這個決定壓力很大，甚至讓他失眠；會議中柯文哲雖信心喊話，但一度哽咽、潸然淚下。
藍白合政黨協商15日在前總統馬英九見證下達成共識，由民調統計專家檢視評估11月7日至11月17日社會各界公布的民調結果，及國民黨、民眾黨各提供一份內參民調的結果。雙方同意，若超過統計誤差，由勝者得一點，若在統計誤差範圍內，由侯柯配得一點。
不過，柯文哲事後坦言「被突襲」，並坦言做決定前幕僚群事先都不知情；15日藍白合協商共識出爐後，輔選幹部一片低氣壓，許多支持者更感到失望，紛紛到柯文哲的臉書抱怨，很多支持者問他「說好的義無反顧拼一次呢？」
民眾黨原訂16日下午召開選舉決策委員會，但突然延期，並改成柯文哲跟民眾黨的競選幹部舉行線上會議；線上會議成員包含民眾黨中央委員會、選舉決策委員會、組織部幹部、各縣市黨部主委，成員約100人。
與會者轉述，柯文哲在線上會議中解釋，他在中南部走動時看到許多人生活困苦、對時局感到徬徨，這對他造成很大壓力，而他也深諳民進黨繼續執政，經濟一定會不好，台灣更會陷入戰爭風險，因此體認到一定要政黨輪替，才做出藍白合決定。
據轉述，柯文哲提到，做決定後根本沒睡好，晚上還失眠，但他想起支持者曾說過：「只要阿北不放棄，我們也不會放棄」；會議中柯文哲一度情緒上來，講到哽咽，眼淚撲簌簌落下。柯文哲在會中對競選幹部信心喊話並指稱，雖然這個決定壓力很大，但過去這段時間的民調其實都是他領先。
與會者指出，柯文哲強調，18日有信心會贏，選民不要灰心喪志，這一兩天還是要努力接民調電話。有些與會者心疼柯文哲，也有人被柯文哲的談話感動，情不自禁就哭出來；也有人認為，幹部志工自己出錢出力，追隨柯文哲4年，並認為即便做這個決定，柯文哲也應走自己的路。